bioinformatica – RisorseWeb

Ensembl Genome Browser

26 Novembre 202118 Novembre 2021 di Biblioteca di Scienze

Database nato dalla collaborazione tra European Informatics Institute e Wellcome Trust Sanger Institute per sviluppare un sistema di software che produce e gestisce in modo automatico le annotazioni su alcuni genomi eucariotici.

Uniprot

26 Novembre 202118 Novembre 2021 di Biblioteca di Scienze

Database di sequenze proteiche che contiene un gran numero di annotazioni (descrizione della funzione di una proteina, i suoi domini, le modificazioni post-trascrizionali, le varianti ecc.), un bassissimo livello di ridondanza e un alto livello di integrazione con gli altri database biologici.

SMART: Simple Modular Architecture Research Tool

16 Dicembre 202118 Novembre 2021 di Biblioteca di Scienze

Database biologico utilizzato per l’identificazione e l’analisi di domini proteici all’interno di sequenze proteiche

PDBsum home page

16 Dicembre 202118 Novembre 2021 di Biblioteca di Scienze

Raccolta di immagini che permette di avere un’anteprima del contenuto delle strutture in 3D delle proteine raccolte da Protein Data Bank. Mostra le molecole che sostengono la struttura e uno schema delle loro integrazioni.

Swiss-PdbViewer

16 Dicembre 202118 Novembre 2021 di Biblioteca di Scienze

Programma di grafica che permette di vedere la struttura di una proteina e analizzare più proteine contemporaneamente; grazie ad un’interfaccia intuitiva, si possono ottenere mutazioni degli amminoacidi, legami H, angoli e distanze tra gli atomi. È possibile inoltre creare modelli inserendo una sequenza primaria di proteine su un modello 3D e ottenere un feedback immediato.